Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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ChfrQ810L3 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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ChfrQ810L3 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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ChfrQ810L3 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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ChfrQ810L3 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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ChfrQ810L3 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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ChfrQ810L3 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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ChfrQ810L3 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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ChfrQ810L3 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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ChfrQ810L3 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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ChfrQ810L3 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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ChfrQ810L3 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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ChfrQ810L3 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ChfrQ810L3 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms