Protein–RNA interactions for Protein: Q80XK6

Atg2b, Autophagy-related protein 2 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 2,075 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2bQ80XK6 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg2bQ80XK6 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms