Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms