Protein–RNA interactions for Protein: Q64674

Srm, Spermidine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrmQ64674 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SrmQ64674 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Olfr1113-202ENSMUST00000215611 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Scnn1b-201ENSMUST00000033161 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SrmQ64674 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SrmQ64674 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
SrmQ64674 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SrmQ64674 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SrmQ64674 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SrmQ64674 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SrmQ64674 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SrmQ64674 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SrmQ64674 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SrmQ64674 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms