Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc18Q640L5 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc18Q640L5 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc18Q640L5 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc18Q640L5 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc18Q640L5 Mapk1ip1-201ENSMUST00000075667 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc18Q640L5 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc18Q640L5 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc18Q640L5 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc18Q640L5 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc18Q640L5 Gm13871-202ENSMUST00000107319 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc18Q640L5 Gm11757-202ENSMUST00000107321 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc18Q640L5 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc18Q640L5 Gm11981-201ENSMUST00000139769 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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Ccdc18Q640L5 Lockd-205ENSMUST00000185152 496 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc18Q640L5 AC105408.1-201ENSMUST00000227771 802 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
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Ccdc18Q640L5 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc18Q640L5 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc18Q640L5 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc18Q640L5 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc18Q640L5 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc18Q640L5 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc18Q640L5 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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Ccdc18Q640L5 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc18Q640L5 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc18Q640L5 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc18Q640L5 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc18Q640L5 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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Ccdc18Q640L5 Gm12052-201ENSMUST00000142151 933 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc18Q640L5 1700009J07Rik-202ENSMUST00000185309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc18Q640L5 Tmprss11c-202ENSMUST00000196462 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
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Ccdc18Q640L5 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc18Q640L5 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc18Q640L5 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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Ccdc18Q640L5 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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Ccdc18Q640L5 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc18Q640L5 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
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Ccdc18Q640L5 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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Ccdc18Q640L5 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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Ccdc18Q640L5 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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Ccdc18Q640L5 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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Ccdc18Q640L5 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc18Q640L5 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc18Q640L5 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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Ccdc18Q640L5 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc18Q640L5 Gm12246-201ENSMUST00000129126 503 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc18Q640L5 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc18Q640L5 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc18Q640L5 Gm27211-201ENSMUST00000183507 631 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
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Ccdc18Q640L5 Gm19014-201ENSMUST00000184828 1189 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc18Q640L5 Gm20781-201ENSMUST00000193154 693 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc18Q640L5 Gm21736-201ENSMUST00000195399 693 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc18Q640L5 Gm26782-203ENSMUST00000227103 751 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc18Q640L5 Lsm3-201ENSMUST00000040607 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc18Q640L5 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc18Q640L5 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc18Q640L5 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc18Q640L5 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc18Q640L5 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc18Q640L5 Gm15519-201ENSMUST00000120088 1566 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc18Q640L5 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
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