Protein–RNA interactions for Protein: Q61508

Ecm1, Extracellular matrix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm1Q61508 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ecm1Q61508 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ecm1Q61508 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ecm1Q61508 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ecm1Q61508 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ecm1Q61508 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ecm1Q61508 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ecm1Q61508 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ecm1Q61508 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ecm1Q61508 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ecm1Q61508 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ecm1Q61508 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ecm1Q61508 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ecm1Q61508 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ecm1Q61508 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ecm1Q61508 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ecm1Q61508 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ecm1Q61508 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ecm1Q61508 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ecm1Q61508 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ecm1Q61508 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ecm1Q61508 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ecm1Q61508 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ecm1Q61508 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ecm1Q61508 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ecm1Q61508 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ecm1Q61508 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ecm1Q61508 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ecm1Q61508 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ecm1Q61508 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ecm1Q61508 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ecm1Q61508 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ecm1Q61508 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ecm1Q61508 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ecm1Q61508 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ecm1Q61508 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ecm1Q61508 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ecm1Q61508 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ecm1Q61508 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ecm1Q61508 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ecm1Q61508 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ecm1Q61508 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ecm1Q61508 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Ecm1Q61508 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ecm1Q61508 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ecm1Q61508 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ecm1Q61508 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ecm1Q61508 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ecm1Q61508 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ecm1Q61508 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ecm1Q61508 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ecm1Q61508 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ecm1Q61508 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ecm1Q61508 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ecm1Q61508 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ecm1Q61508 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ecm1Q61508 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ecm1Q61508 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ecm1Q61508 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ecm1Q61508 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ecm1Q61508 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ecm1Q61508 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ecm1Q61508 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ecm1Q61508 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ecm1Q61508 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ecm1Q61508 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ecm1Q61508 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ecm1Q61508 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ecm1Q61508 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Ecm1Q61508 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ecm1Q61508 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ecm1Q61508 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ecm1Q61508 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ecm1Q61508 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ecm1Q61508 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ecm1Q61508 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ecm1Q61508 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ecm1Q61508 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ecm1Q61508 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ecm1Q61508 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ecm1Q61508 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ecm1Q61508 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ecm1Q61508 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ecm1Q61508 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ecm1Q61508 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ecm1Q61508 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ecm1Q61508 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ecm1Q61508 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ecm1Q61508 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ecm1Q61508 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ecm1Q61508 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ecm1Q61508 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ecm1Q61508 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ecm1Q61508 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ecm1Q61508 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ecm1Q61508 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ecm1Q61508 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ecm1Q61508 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ecm1Q61508 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ecm1Q61508 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms