Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms