Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Gm12073-201ENSMUST00000117382 524 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Gm14739-201ENSMUST00000120424 802 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Gm6027-201ENSMUST00000121467 756 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Gm11656-201ENSMUST00000137462 395 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 AW495222-202ENSMUST00000149839 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Gm17063-201ENSMUST00000168135 456 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 AC115784.1-201ENSMUST00000227687 1010 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 AC154683.1-201ENSMUST00000228409 1284 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Olfr19-201ENSMUST00000057886 1142 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
PtprnQ60673 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Mir1192-201ENSMUST00000116976 121 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Klra5-202ENSMUST00000118060 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Gm25295-201ENSMUST00000122794 306 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Klra5-201ENSMUST00000014683 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Gm15882-201ENSMUST00000161344 855 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Gm7247-201ENSMUST00000162998 1157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Gm43263-201ENSMUST00000201619 560 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Gm4803-201ENSMUST00000218729 1279 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 AC242269.1-201ENSMUST00000227020 741 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms