Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZG4

Taf3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 932 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf3Q5HZG4 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Taf3Q5HZG4 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Taf3Q5HZG4 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Taf3Q5HZG4 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Taf3Q5HZG4 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Taf3Q5HZG4 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Taf3Q5HZG4 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Taf3Q5HZG4 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Taf3Q5HZG4 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Taf3Q5HZG4 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Taf3Q5HZG4 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Taf3Q5HZG4 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Taf3Q5HZG4 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Taf3Q5HZG4 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Taf3Q5HZG4 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Taf3Q5HZG4 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Taf3Q5HZG4 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf3Q5HZG4 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf3Q5HZG4 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf3Q5HZG4 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf3Q5HZG4 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf3Q5HZG4 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf3Q5HZG4 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf3Q5HZG4 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf3Q5HZG4 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf3Q5HZG4 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf3Q5HZG4 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf3Q5HZG4 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf3Q5HZG4 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf3Q5HZG4 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf3Q5HZG4 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf3Q5HZG4 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf3Q5HZG4 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf3Q5HZG4 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf3Q5HZG4 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf3Q5HZG4 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf3Q5HZG4 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf3Q5HZG4 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf3Q5HZG4 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf3Q5HZG4 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf3Q5HZG4 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf3Q5HZG4 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf3Q5HZG4 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf3Q5HZG4 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf3Q5HZG4 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf3Q5HZG4 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf3Q5HZG4 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf3Q5HZG4 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf3Q5HZG4 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf3Q5HZG4 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf3Q5HZG4 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf3Q5HZG4 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf3Q5HZG4 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf3Q5HZG4 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf3Q5HZG4 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf3Q5HZG4 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf3Q5HZG4 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf3Q5HZG4 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf3Q5HZG4 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf3Q5HZG4 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf3Q5HZG4 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf3Q5HZG4 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Taf3Q5HZG4 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Taf3Q5HZG4 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Taf3Q5HZG4 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Taf3Q5HZG4 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Taf3Q5HZG4 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Taf3Q5HZG4 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Taf3Q5HZG4 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Taf3Q5HZG4 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Taf3Q5HZG4 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Taf3Q5HZG4 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Taf3Q5HZG4 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Taf3Q5HZG4 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Taf3Q5HZG4 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Taf3Q5HZG4 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Taf3Q5HZG4 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Taf3Q5HZG4 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Taf3Q5HZG4 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Taf3Q5HZG4 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Taf3Q5HZG4 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Taf3Q5HZG4 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Taf3Q5HZG4 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Taf3Q5HZG4 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Taf3Q5HZG4 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Taf3Q5HZG4 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Taf3Q5HZG4 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Taf3Q5HZG4 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Taf3Q5HZG4 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Taf3Q5HZG4 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Taf3Q5HZG4 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Taf3Q5HZG4 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Taf3Q5HZG4 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Taf3Q5HZG4 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Taf3Q5HZG4 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Taf3Q5HZG4 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Taf3Q5HZG4 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Taf3Q5HZG4 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Taf3Q5HZG4 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Taf3Q5HZG4 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms