Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Gm14222-201ENSMUST00000128681 575 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fam208bQ5DTT3 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Gm25998-201ENSMUST00000175397 53 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Gng5-ps-201ENSMUST00000120931 205 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Mir6941-201ENSMUST00000184711 59 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Gm5870-201ENSMUST00000196461 282 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms