Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDG0

Slc27a5, Bile acyl-CoA synthetase, mousemouse

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a5Q4LDG0 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc27a5Q4LDG0 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc27a5Q4LDG0 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc27a5Q4LDG0 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc27a5Q4LDG0 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc27a5Q4LDG0 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc27a5Q4LDG0 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc27a5Q4LDG0 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc27a5Q4LDG0 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc27a5Q4LDG0 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc27a5Q4LDG0 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc27a5Q4LDG0 Gm12484-201ENSMUST00000156311 581 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc27a5Q4LDG0 Gm17134-201ENSMUST00000166593 437 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc27a5Q4LDG0 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc27a5Q4LDG0 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc27a5Q4LDG0 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc27a5Q4LDG0 Vmn1r10-201ENSMUST00000176073 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc27a5Q4LDG0 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc27a5Q4LDG0 Gm5930-202ENSMUST00000178002 489 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc27a5Q4LDG0 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc27a5Q4LDG0 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc27a5Q4LDG0 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc27a5Q4LDG0 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc27a5Q4LDG0 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc27a5Q4LDG0 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc27a5Q4LDG0 Gm19211-201ENSMUST00000200251 1206 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc27a5Q4LDG0 Gm18012-201ENSMUST00000204558 773 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc27a5Q4LDG0 Olfr1439-ps1-201ENSMUST00000207089 824 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc27a5Q4LDG0 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc27a5Q4LDG0 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc27a5Q4LDG0 AC153516.1-201ENSMUST00000217955 779 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc27a5Q4LDG0 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc27a5Q4LDG0 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc27a5Q4LDG0 9530050K03Rik-201ENSMUST00000221663 1299 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc27a5Q4LDG0 Vmn1r20-201ENSMUST00000226808 912 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc27a5Q4LDG0 AC154627.1-201ENSMUST00000228799 1286 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc27a5Q4LDG0 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc27a5Q4LDG0 Olfr780-201ENSMUST00000063168 1025 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc27a5Q4LDG0 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc27a5Q4LDG0 Rnase1-201ENSMUST00000080126 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc27a5Q4LDG0 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc27a5Q4LDG0 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc27a5Q4LDG0 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc27a5Q4LDG0 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc27a5Q4LDG0 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc27a5Q4LDG0 Vmn1r27-201ENSMUST00000095862 912 ntAPPRIS P2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc27a5Q4LDG0 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc27a5Q4LDG0 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc27a5Q4LDG0 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc27a5Q4LDG0 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc27a5Q4LDG0 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc27a5Q4LDG0 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc27a5Q4LDG0 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc27a5Q4LDG0 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc27a5Q4LDG0 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc27a5Q4LDG0 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc27a5Q4LDG0 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc27a5Q4LDG0 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc27a5Q4LDG0 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc27a5Q4LDG0 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc27a5Q4LDG0 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc27a5Q4LDG0 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc27a5Q4LDG0 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Slc27a5Q4LDG0 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Slc27a5Q4LDG0 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Slc27a5Q4LDG0 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Slc27a5Q4LDG0 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Slc27a5Q4LDG0 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Slc27a5Q4LDG0 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Slc27a5Q4LDG0 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Slc27a5Q4LDG0 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Slc27a5Q4LDG0 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Slc27a5Q4LDG0 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Slc27a5Q4LDG0 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Slc27a5Q4LDG0 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Slc27a5Q4LDG0 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Slc27a5Q4LDG0 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Slc27a5Q4LDG0 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Slc27a5Q4LDG0 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Slc27a5Q4LDG0 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Slc27a5Q4LDG0 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Slc27a5Q4LDG0 Gm13206-201ENSMUST00000129579 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Slc27a5Q4LDG0 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Slc27a5Q4LDG0 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Slc27a5Q4LDG0 Gm27025-201ENSMUST00000182392 942 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Slc27a5Q4LDG0 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Slc27a5Q4LDG0 Gm26916-201ENSMUST00000183304 352 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Slc27a5Q4LDG0 Gm28750-201ENSMUST00000186327 658 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Slc27a5Q4LDG0 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Slc27a5Q4LDG0 Gm43539-201ENSMUST00000196190 363 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Slc27a5Q4LDG0 Gm18290-201ENSMUST00000202900 844 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Slc27a5Q4LDG0 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Slc27a5Q4LDG0 Olfr540-ps1-201ENSMUST00000210499 612 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Slc27a5Q4LDG0 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Slc27a5Q4LDG0 E230034D01Rik-203ENSMUST00000217357 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Slc27a5Q4LDG0 A430103D13Rik-201ENSMUST00000220077 857 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Slc27a5Q4LDG0 AC154594.1-201ENSMUST00000225171 1273 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Slc27a5Q4LDG0 AC154747.1-201ENSMUST00000225265 239 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Slc27a5Q4LDG0 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Slc27a5Q4LDG0 AC107711.3-201ENSMUST00000228939 1035 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms