Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXB0

Mbd3l2, Methyl-CpG-binding domain protein 3-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3l2Q3UXB0 Cyp26b1-205ENSMUST00000205228 4288 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Mbd3l2Q3UXB0 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Mbd3l2Q3UXB0 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Mbd3l2Q3UXB0 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Mbd3l2Q3UXB0 Nek4-203ENSMUST00000226551 4098 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Mbd3l2Q3UXB0 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Mbd3l2Q3UXB0 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Mbd3l2Q3UXB0 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Mbd3l2Q3UXB0 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Mbd3l2Q3UXB0 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Mbd3l2Q3UXB0 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Mbd3l2Q3UXB0 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Mbd3l2Q3UXB0 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Mbd3l2Q3UXB0 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Mbd3l2Q3UXB0 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Mbd3l2Q3UXB0 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Mbd3l2Q3UXB0 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Mbd3l2Q3UXB0 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Mbd3l2Q3UXB0 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Mbd3l2Q3UXB0 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Mbd3l2Q3UXB0 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Mbd3l2Q3UXB0 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Mbd3l2Q3UXB0 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Mbd3l2Q3UXB0 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Mbd3l2Q3UXB0 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Mbd3l2Q3UXB0 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Mbd3l2Q3UXB0 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Mbd3l2Q3UXB0 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Mbd3l2Q3UXB0 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Mbd3l2Q3UXB0 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Mbd3l2Q3UXB0 Clip1-203ENSMUST00000111561 5883 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Mbd3l2Q3UXB0 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Mbd3l2Q3UXB0 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Mbd3l2Q3UXB0 Ltbp1-203ENSMUST00000112516 5140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Mbd3l2Q3UXB0 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Mbd3l2Q3UXB0 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Mbd3l2Q3UXB0 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Mbd3l2Q3UXB0 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Mbd3l2Q3UXB0 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Mbd3l2Q3UXB0 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Mbd3l2Q3UXB0 Galnt16-206ENSMUST00000219993 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Mbd3l2Q3UXB0 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Mbd3l2Q3UXB0 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Mbd3l2Q3UXB0 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Mbd3l2Q3UXB0 Wars-205ENSMUST00000161410 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Mbd3l2Q3UXB0 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Mbd3l2Q3UXB0 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Mbd3l2Q3UXB0 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Mbd3l2Q3UXB0 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Mbd3l2Q3UXB0 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Mbd3l2Q3UXB0 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Mbd3l2Q3UXB0 Gm43372-201ENSMUST00000202662 3016 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Mbd3l2Q3UXB0 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Mbd3l2Q3UXB0 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Mbd3l2Q3UXB0 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Mbd3l2Q3UXB0 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Mbd3l2Q3UXB0 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Mbd3l2Q3UXB0 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Mbd3l2Q3UXB0 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Mbd3l2Q3UXB0 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Mbd3l2Q3UXB0 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Mbd3l2Q3UXB0 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Mbd3l2Q3UXB0 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Mbd3l2Q3UXB0 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Mbd3l2Q3UXB0 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Mbd3l2Q3UXB0 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Mbd3l2Q3UXB0 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Mbd3l2Q3UXB0 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Mbd3l2Q3UXB0 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Mbd3l2Q3UXB0 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Mbd3l2Q3UXB0 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Mbd3l2Q3UXB0 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Mbd3l2Q3UXB0 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Mbd3l2Q3UXB0 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Mbd3l2Q3UXB0 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Mbd3l2Q3UXB0 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Mbd3l2Q3UXB0 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Mbd3l2Q3UXB0 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Mbd3l2Q3UXB0 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Mbd3l2Q3UXB0 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Mbd3l2Q3UXB0 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Mbd3l2Q3UXB0 Rbm3-201ENSMUST00000040010 2792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Mbd3l2Q3UXB0 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Mbd3l2Q3UXB0 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Mbd3l2Q3UXB0 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Mbd3l2Q3UXB0 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Mbd3l2Q3UXB0 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Mbd3l2Q3UXB0 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Mbd3l2Q3UXB0 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Mbd3l2Q3UXB0 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Mbd3l2Q3UXB0 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Mbd3l2Q3UXB0 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Mbd3l2Q3UXB0 Nrap-202ENSMUST00000073536 5501 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Mbd3l2Q3UXB0 Eif2ak4-201ENSMUST00000005233 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Mbd3l2Q3UXB0 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Mbd3l2Q3UXB0 Capn8-201ENSMUST00000048941 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Mbd3l2Q3UXB0 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Mbd3l2Q3UXB0 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Mbd3l2Q3UXB0 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Mbd3l2Q3UXB0 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms