Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Q3U6N9 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Q3U6N9 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q3U6N9 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q3U6N9 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q3U6N9 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q3U6N9 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Q3U6N9 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q3U6N9 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q3U6N9 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q3U6N9 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q3U6N9 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q3U6N9 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q3U6N9 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q3U6N9 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q3U6N9 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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