Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Rnf149Q3U2C5 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Rnf149Q3U2C5 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Rnf149Q3U2C5 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Rnf149Q3U2C5 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Rnf149Q3U2C5 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Rnf149Q3U2C5 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Rnf149Q3U2C5 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
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