Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXT3

Inip, SOSS complex subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
InipQ3TXT3 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
InipQ3TXT3 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
InipQ3TXT3 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
InipQ3TXT3 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
InipQ3TXT3 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
InipQ3TXT3 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
InipQ3TXT3 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
InipQ3TXT3 Gm13694-201ENSMUST00000178533 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
InipQ3TXT3 Gm13693-201ENSMUST00000178960 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
InipQ3TXT3 Gm13698-202ENSMUST00000179192 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
InipQ3TXT3 Gm13696-202ENSMUST00000180347 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
InipQ3TXT3 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
InipQ3TXT3 Gm13691-201ENSMUST00000099947 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
InipQ3TXT3 Gm13697-201ENSMUST00000099948 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
InipQ3TXT3 Gm13695-201ENSMUST00000099951 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
InipQ3TXT3 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
InipQ3TXT3 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
InipQ3TXT3 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
InipQ3TXT3 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
InipQ3TXT3 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
InipQ3TXT3 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
InipQ3TXT3 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
InipQ3TXT3 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
InipQ3TXT3 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
InipQ3TXT3 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
InipQ3TXT3 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
InipQ3TXT3 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
InipQ3TXT3 Tmem126b-201ENSMUST00000032843 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
InipQ3TXT3 Gm11131-201ENSMUST00000113886 3122 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
InipQ3TXT3 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
InipQ3TXT3 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
InipQ3TXT3 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
InipQ3TXT3 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
InipQ3TXT3 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
InipQ3TXT3 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
InipQ3TXT3 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
InipQ3TXT3 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
InipQ3TXT3 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
InipQ3TXT3 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
InipQ3TXT3 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
InipQ3TXT3 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
InipQ3TXT3 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
InipQ3TXT3 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
InipQ3TXT3 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
InipQ3TXT3 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
InipQ3TXT3 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
InipQ3TXT3 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
InipQ3TXT3 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
InipQ3TXT3 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
InipQ3TXT3 6430562O15Rik-201ENSMUST00000180491 2488 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
InipQ3TXT3 Gm13437-201ENSMUST00000122434 1981 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
InipQ3TXT3 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
InipQ3TXT3 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
InipQ3TXT3 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
InipQ3TXT3 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
InipQ3TXT3 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
InipQ3TXT3 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
InipQ3TXT3 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
InipQ3TXT3 Meox2-201ENSMUST00000041183 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
InipQ3TXT3 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
InipQ3TXT3 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
InipQ3TXT3 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
InipQ3TXT3 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
InipQ3TXT3 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
InipQ3TXT3 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
InipQ3TXT3 Robo4-203ENSMUST00000115048 3392 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
InipQ3TXT3 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
InipQ3TXT3 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
InipQ3TXT3 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
InipQ3TXT3 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
InipQ3TXT3 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
InipQ3TXT3 Dhx40-201ENSMUST00000018569 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
InipQ3TXT3 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
InipQ3TXT3 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
InipQ3TXT3 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
InipQ3TXT3 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
InipQ3TXT3 Txnrd1-201ENSMUST00000020484 3325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
InipQ3TXT3 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
InipQ3TXT3 Nfyc-204ENSMUST00000120779 2006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
InipQ3TXT3 Capn8-201ENSMUST00000048941 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
InipQ3TXT3 Gpr35-202ENSMUST00000064480 3409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
InipQ3TXT3 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
InipQ3TXT3 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
InipQ3TXT3 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
InipQ3TXT3 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
InipQ3TXT3 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
InipQ3TXT3 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
InipQ3TXT3 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
InipQ3TXT3 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
InipQ3TXT3 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
InipQ3TXT3 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
InipQ3TXT3 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
InipQ3TXT3 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
InipQ3TXT3 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
InipQ3TXT3 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
InipQ3TXT3 Il10ra-202ENSMUST00000176222 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
InipQ3TXT3 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
InipQ3TXT3 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
InipQ3TXT3 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
InipQ3TXT3 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms