Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

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Length 542 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 1700001C02Rik-202ENSMUST00000114743 729 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Gm11502-201ENSMUST00000120917 1211 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 AC034099.1-202ENSMUST00000133843 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Cnfn-202ENSMUST00000167591 698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Gm29763-201ENSMUST00000205306 616 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Olfr314-201ENSMUST00000076393 1131 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
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Samd11Q1RNF8 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Samd11Q1RNF8 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Samd11Q1RNF8 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Samd11Q1RNF8 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Apobr-203ENSMUST00000137646 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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