Protein–RNA interactions for Protein: Q1ERP8

Cd300lg, CMRF35-like molecule 9, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300lgQ1ERP8 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cd300lgQ1ERP8 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cd300lgQ1ERP8 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cd300lgQ1ERP8 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cd300lgQ1ERP8 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cd300lgQ1ERP8 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cd300lgQ1ERP8 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cd300lgQ1ERP8 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cd300lgQ1ERP8 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cd300lgQ1ERP8 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cd300lgQ1ERP8 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cd300lgQ1ERP8 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cd300lgQ1ERP8 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cd300lgQ1ERP8 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cd300lgQ1ERP8 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cd300lgQ1ERP8 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Cd300lgQ1ERP8 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Cd300lgQ1ERP8 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Cd300lgQ1ERP8 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
Cd300lgQ1ERP8 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Cd300lgQ1ERP8 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cd300lgQ1ERP8 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cd300lgQ1ERP8 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Cd300lgQ1ERP8 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Cd300lgQ1ERP8 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cd300lgQ1ERP8 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cd300lgQ1ERP8 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cd300lgQ1ERP8 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cd300lgQ1ERP8 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cd300lgQ1ERP8 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Cd300lgQ1ERP8 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cd300lgQ1ERP8 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cd300lgQ1ERP8 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Cd300lgQ1ERP8 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cd300lgQ1ERP8 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cd300lgQ1ERP8 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cd300lgQ1ERP8 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cd300lgQ1ERP8 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cd300lgQ1ERP8 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cd300lgQ1ERP8 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cd300lgQ1ERP8 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cd300lgQ1ERP8 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cd300lgQ1ERP8 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cd300lgQ1ERP8 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cd300lgQ1ERP8 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cd300lgQ1ERP8 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cd300lgQ1ERP8 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cd300lgQ1ERP8 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cd300lgQ1ERP8 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cd300lgQ1ERP8 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cd300lgQ1ERP8 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cd300lgQ1ERP8 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cd300lgQ1ERP8 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cd300lgQ1ERP8 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cd300lgQ1ERP8 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cd300lgQ1ERP8 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cd300lgQ1ERP8 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cd300lgQ1ERP8 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cd300lgQ1ERP8 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cd300lgQ1ERP8 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cd300lgQ1ERP8 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cd300lgQ1ERP8 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cd300lgQ1ERP8 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cd300lgQ1ERP8 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cd300lgQ1ERP8 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cd300lgQ1ERP8 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cd300lgQ1ERP8 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cd300lgQ1ERP8 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Cd300lgQ1ERP8 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cd300lgQ1ERP8 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cd300lgQ1ERP8 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cd300lgQ1ERP8 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cd300lgQ1ERP8 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cd300lgQ1ERP8 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Cd300lgQ1ERP8 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Cd300lgQ1ERP8 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Cd300lgQ1ERP8 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cd300lgQ1ERP8 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cd300lgQ1ERP8 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cd300lgQ1ERP8 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cd300lgQ1ERP8 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cd300lgQ1ERP8 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cd300lgQ1ERP8 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cd300lgQ1ERP8 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Cd300lgQ1ERP8 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cd300lgQ1ERP8 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cd300lgQ1ERP8 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cd300lgQ1ERP8 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Cd300lgQ1ERP8 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Cd300lgQ1ERP8 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cd300lgQ1ERP8 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cd300lgQ1ERP8 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cd300lgQ1ERP8 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cd300lgQ1ERP8 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cd300lgQ1ERP8 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cd300lgQ1ERP8 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cd300lgQ1ERP8 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cd300lgQ1ERP8 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cd300lgQ1ERP8 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cd300lgQ1ERP8 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms