Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.4 ms