Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vps8Q0P5W1 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms