Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Sptb-202ENSMUST00000166101 8084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Svil-211ENSMUST00000143254 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC9.15□□□□□ -0.95
Cdx4Q07424 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Cdx4Q07424 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Cdx4Q07424 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Cdx4Q07424 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
Cdx4Q07424 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Cdx4Q07424 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Cdx4Q07424 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Cdx4Q07424 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cdx4Q07424 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cdx4Q07424 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cdx4Q07424 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cdx4Q07424 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cdx4Q07424 Hivep1-201ENSMUST00000060148 8753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cdx4Q07424 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cdx4Q07424 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cdx4Q07424 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cdx4Q07424 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Cdx4Q07424 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cdx4Q07424 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cdx4Q07424 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cdx4Q07424 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cdx4Q07424 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cdx4Q07424 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cdx4Q07424 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cdx4Q07424 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cdx4Q07424 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cdx4Q07424 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cdx4Q07424 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cdx4Q07424 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cdx4Q07424 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms