Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Gm11993-201ENSMUST00000121861 820 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Gm9625-201ENSMUST00000180422 955 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Tpi-rs4-201ENSMUST00000213734 720 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 AC137871.1-201ENSMUST00000228278 475 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Eef1akmt4-202ENSMUST00000119224 1464 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Gm24078-201ENSMUST00000158184 103 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Tex33-203ENSMUST00000169575 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Gm27440-201ENSMUST00000184785 107 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Gm43564-201ENSMUST00000196185 211 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Gm13171-201ENSMUST00000117233 391 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Mocs2-201ENSMUST00000015680 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Gm17796-201ENSMUST00000189015 1213 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 BC049987-201ENSMUST00000213859 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Rp9-204ENSMUST00000216973 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 AC124752.1-201ENSMUST00000222131 776 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 AC105408.1-201ENSMUST00000227771 802 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Taar7a-201ENSMUST00000078532 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Taar7b-201ENSMUST00000092658 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Tbp-203ENSMUST00000118001 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Gatb-203ENSMUST00000107674 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Gm4858-201ENSMUST00000179064 735 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 AC164556.1-201ENSMUST00000221318 751 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Ensa-202ENSMUST00000058230 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Gm10580-201ENSMUST00000097985 396 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Gm10582-201ENSMUST00000097987 396 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Gm10583-201ENSMUST00000097988 396 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Mapk1ip1-201ENSMUST00000075667 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grin2bQ01097 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms