Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb2Q00977 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms