Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms