Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nbr1P97432 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nbr1P97432 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Nbr1P97432 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nbr1P97432 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nbr1P97432 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nbr1P97432 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nbr1P97432 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nbr1P97432 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nbr1P97432 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Nbr1P97432 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nbr1P97432 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nbr1P97432 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nbr1P97432 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nbr1P97432 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Nbr1P97432 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nbr1P97432 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nbr1P97432 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Nbr1P97432 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nbr1P97432 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nbr1P97432 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nbr1P97432 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nbr1P97432 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nbr1P97432 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nbr1P97432 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nbr1P97432 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nbr1P97432 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nbr1P97432 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nbr1P97432 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nbr1P97432 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Nbr1P97432 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Nbr1P97432 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Nbr1P97432 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Nbr1P97432 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nbr1P97432 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nbr1P97432 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Nbr1P97432 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Nbr1P97432 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nbr1P97432 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Nbr1P97432 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nbr1P97432 Pbld1-202ENSMUST00000178684 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nbr1P97432 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nbr1P97432 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nbr1P97432 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nbr1P97432 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nbr1P97432 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms