Protein–RNA interactions for Protein: P82347

Sgcd, Delta-sarcoglycan, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcdP82347 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SgcdP82347 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SgcdP82347 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SgcdP82347 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SgcdP82347 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SgcdP82347 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Wdcp-201ENSMUST00000053034 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SgcdP82347 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SgcdP82347 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Atl2-201ENSMUST00000068282 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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SgcdP82347 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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SgcdP82347 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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SgcdP82347 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SgcdP82347 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SgcdP82347 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SgcdP82347 Glt1d1-201ENSMUST00000118139 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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