Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Irx3P81067 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Irx3P81067 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Irx3P81067 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Irx3P81067 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Irx3P81067 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Irx3P81067 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Irx3P81067 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Irx3P81067 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Irx3P81067 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Irx3P81067 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Irx3P81067 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Irx3P81067 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Irx3P81067 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Irx3P81067 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Irx3P81067 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Irx3P81067 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Irx3P81067 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Irx3P81067 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Irx3P81067 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Irx3P81067 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Irx3P81067 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Irx3P81067 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Irx3P81067 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Irx3P81067 Gm13615-201ENSMUST00000120242 1612 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Irx3P81067 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irx3P81067 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irx3P81067 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irx3P81067 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irx3P81067 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irx3P81067 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irx3P81067 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irx3P81067 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irx3P81067 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irx3P81067 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irx3P81067 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Irx3P81067 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irx3P81067 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Irx3P81067 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irx3P81067 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irx3P81067 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Irx3P81067 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irx3P81067 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Irx3P81067 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Irx3P81067 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Irx3P81067 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irx3P81067 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irx3P81067 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irx3P81067 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irx3P81067 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Irx3P81067 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irx3P81067 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irx3P81067 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irx3P81067 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irx3P81067 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irx3P81067 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irx3P81067 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irx3P81067 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irx3P81067 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irx3P81067 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Irx3P81067 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irx3P81067 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irx3P81067 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irx3P81067 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irx3P81067 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irx3P81067 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irx3P81067 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irx3P81067 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irx3P81067 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irx3P81067 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irx3P81067 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irx3P81067 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irx3P81067 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irx3P81067 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irx3P81067 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Irx3P81067 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Irx3P81067 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Irx3P81067 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irx3P81067 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irx3P81067 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Irx3P81067 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irx3P81067 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irx3P81067 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irx3P81067 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irx3P81067 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irx3P81067 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irx3P81067 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irx3P81067 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irx3P81067 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irx3P81067 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irx3P81067 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irx3P81067 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irx3P81067 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irx3P81067 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irx3P81067 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irx3P81067 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irx3P81067 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irx3P81067 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irx3P81067 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irx3P81067 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 476.6 ms