Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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Hoxd13P70217 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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Hoxd13P70217 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
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