Protein–RNA interactions for Protein: P62270

Rps18, 40S ribosomal protein S18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps18P62270 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps18P62270 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps18P62270 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps18P62270 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rps18P62270 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rps18P62270 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Rps18P62270 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rps18P62270 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rps18P62270 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rps18P62270 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms