Protein–RNA interactions for Protein: P61222

Abce1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abce1P61222 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Abce1P61222 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Abce1P61222 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Abce1P61222 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Abce1P61222 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Abce1P61222 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Abce1P61222 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Abce1P61222 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Abce1P61222 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Abce1P61222 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Abce1P61222 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Abce1P61222 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Abce1P61222 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Abce1P61222 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Abce1P61222 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Abce1P61222 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Abce1P61222 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Abce1P61222 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Abce1P61222 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Abce1P61222 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Abce1P61222 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Abce1P61222 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Abce1P61222 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Abce1P61222 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Abce1P61222 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Abce1P61222 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Abce1P61222 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Abce1P61222 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Abce1P61222 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Abce1P61222 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Abce1P61222 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Abce1P61222 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Abce1P61222 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Abce1P61222 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Abce1P61222 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Abce1P61222 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Abce1P61222 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Abce1P61222 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Abce1P61222 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Abce1P61222 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Abce1P61222 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Abce1P61222 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Abce1P61222 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Abce1P61222 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Abce1P61222 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Abce1P61222 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Abce1P61222 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Abce1P61222 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Abce1P61222 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Abce1P61222 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Abce1P61222 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Abce1P61222 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Abce1P61222 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Abce1P61222 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Abce1P61222 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Abce1P61222 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Abce1P61222 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Abce1P61222 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Abce1P61222 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Abce1P61222 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Abce1P61222 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Abce1P61222 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Abce1P61222 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Abce1P61222 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Abce1P61222 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Abce1P61222 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Abce1P61222 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Abce1P61222 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Abce1P61222 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Abce1P61222 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Abce1P61222 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Abce1P61222 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Abce1P61222 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Abce1P61222 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Abce1P61222 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Abce1P61222 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Abce1P61222 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Abce1P61222 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Abce1P61222 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Abce1P61222 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Abce1P61222 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Abce1P61222 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Abce1P61222 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Abce1P61222 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Abce1P61222 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Abce1P61222 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Abce1P61222 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Abce1P61222 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Abce1P61222 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Abce1P61222 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Abce1P61222 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Abce1P61222 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Abce1P61222 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Abce1P61222 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Abce1P61222 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Abce1P61222 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Abce1P61222 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Abce1P61222 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Abce1P61222 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Abce1P61222 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms