Protein–RNA interactions for Protein: P50704

Defa6, Alpha-defensin 6/12, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa6P50704 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Defa6P50704 Tsc1-204ENSMUST00000113870 7595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Defa6P50704 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Defa6P50704 Sall2-201ENSMUST00000058326 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Defa6P50704 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Defa6P50704 Lrrk1-201ENSMUST00000015277 7465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Defa6P50704 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Defa6P50704 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Defa6P50704 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Defa6P50704 Dysf-204ENSMUST00000113821 6803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.99
Defa6P50704 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Defa6P50704 Ippk-202ENSMUST00000220447 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Defa6P50704 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Defa6P50704 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Defa6P50704 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.99
Defa6P50704 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.99
Defa6P50704 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Defa6P50704 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Defa6P50704 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Defa6P50704 Mcm3ap-201ENSMUST00000170795 6427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Defa6P50704 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Defa6P50704 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Defa6P50704 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Defa6P50704 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Defa6P50704 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Defa6P50704 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Defa6P50704 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Defa6P50704 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Defa6P50704 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Defa6P50704 Gm19972-201ENSMUST00000218180 5664 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Defa6P50704 Mlph-201ENSMUST00000027528 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Defa6P50704 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Defa6P50704 5033428I22Rik-204ENSMUST00000210633 6652 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Defa6P50704 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Defa6P50704 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Defa6P50704 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Defa6P50704 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Defa6P50704 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Defa6P50704 Rnpc3-201ENSMUST00000092154 3888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Defa6P50704 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Defa6P50704 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Defa6P50704 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Defa6P50704 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Defa6P50704 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Defa6P50704 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Defa6P50704 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Defa6P50704 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Defa6P50704 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Defa6P50704 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Defa6P50704 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Defa6P50704 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Defa6P50704 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Defa6P50704 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Defa6P50704 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Defa6P50704 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Defa6P50704 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Defa6P50704 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Defa6P50704 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Defa6P50704 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Defa6P50704 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Defa6P50704 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Defa6P50704 Ehmt1-205ENSMUST00000114432 4539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Defa6P50704 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Defa6P50704 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Defa6P50704 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Defa6P50704 Acot11-202ENSMUST00000102762 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Defa6P50704 Col4a4-201ENSMUST00000087050 10108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Defa6P50704 Ctnnd1-223ENSMUST00000111697 5294 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Defa6P50704 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Defa6P50704 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Defa6P50704 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Defa6P50704 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Defa6P50704 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Defa6P50704 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Defa6P50704 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Defa6P50704 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Defa6P50704 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Defa6P50704 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Defa6P50704 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Defa6P50704 Acsl5-201ENSMUST00000043150 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Defa6P50704 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Defa6P50704 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Defa6P50704 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Defa6P50704 Clasp1-208ENSMUST00000187713 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Defa6P50704 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Defa6P50704 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Defa6P50704 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Defa6P50704 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Defa6P50704 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Defa6P50704 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Defa6P50704 Ar-201ENSMUST00000052837 10048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Defa6P50704 Zfyve1-201ENSMUST00000048319 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Defa6P50704 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Defa6P50704 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Defa6P50704 Limch1-202ENSMUST00000101164 5192 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Defa6P50704 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Defa6P50704 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Defa6P50704 Rbfox2-203ENSMUST00000166610 6573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Defa6P50704 Fubp1-202ENSMUST00000166984 6523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Defa6P50704 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms