Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
TspoP50637 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
TspoP50637 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
TspoP50637 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
TspoP50637 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
TspoP50637 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
TspoP50637 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
TspoP50637 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
TspoP50637 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC9.92□□□□□ -0.82
TspoP50637 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
TspoP50637 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
TspoP50637 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
TspoP50637 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
TspoP50637 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
TspoP50637 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
TspoP50637 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
TspoP50637 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
TspoP50637 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
TspoP50637 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
TspoP50637 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
TspoP50637 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
TspoP50637 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
TspoP50637 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
TspoP50637 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
TspoP50637 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
TspoP50637 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
TspoP50637 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
TspoP50637 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
TspoP50637 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
TspoP50637 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
TspoP50637 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
TspoP50637 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
TspoP50637 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
TspoP50637 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
TspoP50637 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
TspoP50637 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
TspoP50637 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
TspoP50637 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
TspoP50637 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
TspoP50637 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
TspoP50637 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
TspoP50637 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
TspoP50637 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
TspoP50637 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
TspoP50637 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
TspoP50637 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
TspoP50637 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
TspoP50637 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
TspoP50637 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
TspoP50637 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
TspoP50637 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
TspoP50637 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
TspoP50637 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
TspoP50637 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC9.91□□□□□ -0.82
TspoP50637 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC9.91□□□□□ -0.82
TspoP50637 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
TspoP50637 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
TspoP50637 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
TspoP50637 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
TspoP50637 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
TspoP50637 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
TspoP50637 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
TspoP50637 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
TspoP50637 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
TspoP50637 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC9.91□□□□□ -0.82
TspoP50637 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
TspoP50637 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
TspoP50637 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
TspoP50637 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
TspoP50637 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
TspoP50637 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
TspoP50637 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
TspoP50637 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
TspoP50637 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
TspoP50637 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
TspoP50637 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
TspoP50637 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
TspoP50637 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
TspoP50637 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
TspoP50637 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
TspoP50637 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
TspoP50637 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
TspoP50637 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
TspoP50637 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
TspoP50637 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
TspoP50637 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
TspoP50637 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
TspoP50637 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
TspoP50637 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
TspoP50637 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
TspoP50637 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
TspoP50637 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
TspoP50637 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
TspoP50637 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
TspoP50637 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
TspoP50637 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
TspoP50637 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
TspoP50637 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
TspoP50637 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
TspoP50637 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms