Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Epb41P48193 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Epb41P48193 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Epb41P48193 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Epb41P48193 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Epb41P48193 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Epb41P48193 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Epb41P48193 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Epb41P48193 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Epb41P48193 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Epb41P48193 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Epb41P48193 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Epb41P48193 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Epb41P48193 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Epb41P48193 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Epb41P48193 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Epb41P48193 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Epb41P48193 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Epb41P48193 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Epb41P48193 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Epb41P48193 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Epb41P48193 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Epb41P48193 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Epb41P48193 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Epb41P48193 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Epb41P48193 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Epb41P48193 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Epb41P48193 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Epb41P48193 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Epb41P48193 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Epb41P48193 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Epb41P48193 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Epb41P48193 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Epb41P48193 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Epb41P48193 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Epb41P48193 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Epb41P48193 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Epb41P48193 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Epb41P48193 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Epb41P48193 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Epb41P48193 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Epb41P48193 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Epb41P48193 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Epb41P48193 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Epb41P48193 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Epb41P48193 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Epb41P48193 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Epb41P48193 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Epb41P48193 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Epb41P48193 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Epb41P48193 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Epb41P48193 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Epb41P48193 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Epb41P48193 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Epb41P48193 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Epb41P48193 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Epb41P48193 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Epb41P48193 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Epb41P48193 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Epb41P48193 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Epb41P48193 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Epb41P48193 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Epb41P48193 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Epb41P48193 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Epb41P48193 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Epb41P48193 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Epb41P48193 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Epb41P48193 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Epb41P48193 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Epb41P48193 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Epb41P48193 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Epb41P48193 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Epb41P48193 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Epb41P48193 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Epb41P48193 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Epb41P48193 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Epb41P48193 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Epb41P48193 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Epb41P48193 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Epb41P48193 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Epb41P48193 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Epb41P48193 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Epb41P48193 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Epb41P48193 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Epb41P48193 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Epb41P48193 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Epb41P48193 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Epb41P48193 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Epb41P48193 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Epb41P48193 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Epb41P48193 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Epb41P48193 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Epb41P48193 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Epb41P48193 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Epb41P48193 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Epb41P48193 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Epb41P48193 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Epb41P48193 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Epb41P48193 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Epb41P48193 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms