Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms