Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ItgavP43406 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ItgavP43406 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ItgavP43406 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ItgavP43406 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ItgavP43406 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ItgavP43406 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ItgavP43406 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ItgavP43406 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ItgavP43406 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ItgavP43406 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ItgavP43406 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ItgavP43406 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ItgavP43406 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ItgavP43406 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ItgavP43406 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ItgavP43406 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ItgavP43406 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ItgavP43406 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ItgavP43406 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ItgavP43406 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ItgavP43406 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ItgavP43406 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ItgavP43406 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ItgavP43406 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ItgavP43406 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ItgavP43406 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ItgavP43406 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
ItgavP43406 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ItgavP43406 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ItgavP43406 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ItgavP43406 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
ItgavP43406 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ItgavP43406 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ItgavP43406 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ItgavP43406 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ItgavP43406 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ItgavP43406 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ItgavP43406 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
ItgavP43406 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
ItgavP43406 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
ItgavP43406 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ItgavP43406 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ItgavP43406 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ItgavP43406 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ItgavP43406 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ItgavP43406 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ItgavP43406 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ItgavP43406 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ItgavP43406 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ItgavP43406 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
ItgavP43406 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
ItgavP43406 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
ItgavP43406 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ItgavP43406 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ItgavP43406 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ItgavP43406 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ItgavP43406 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ItgavP43406 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ItgavP43406 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ItgavP43406 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ItgavP43406 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ItgavP43406 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ItgavP43406 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ItgavP43406 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ItgavP43406 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ItgavP43406 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ItgavP43406 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ItgavP43406 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ItgavP43406 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ItgavP43406 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
ItgavP43406 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ItgavP43406 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ItgavP43406 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ItgavP43406 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
ItgavP43406 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ItgavP43406 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
ItgavP43406 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ItgavP43406 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ItgavP43406 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
ItgavP43406 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ItgavP43406 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ItgavP43406 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ItgavP43406 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ItgavP43406 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ItgavP43406 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ItgavP43406 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ItgavP43406 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
ItgavP43406 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ItgavP43406 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ItgavP43406 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ItgavP43406 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ItgavP43406 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ItgavP43406 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ItgavP43406 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ItgavP43406 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ItgavP43406 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ItgavP43406 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ItgavP43406 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
ItgavP43406 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms