Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Taf3-204ENSMUST00000114909 4897 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Rpl28P41105 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms