Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TtlP38585 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TtlP38585 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TtlP38585 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TtlP38585 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
TtlP38585 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TtlP38585 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TtlP38585 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TtlP38585 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TtlP38585 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TtlP38585 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
TtlP38585 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TtlP38585 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TtlP38585 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TtlP38585 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TtlP38585 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TtlP38585 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TtlP38585 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TtlP38585 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TtlP38585 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TtlP38585 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TtlP38585 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TtlP38585 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TtlP38585 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
TtlP38585 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TtlP38585 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TtlP38585 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TtlP38585 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TtlP38585 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TtlP38585 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TtlP38585 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TtlP38585 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TtlP38585 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TtlP38585 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TtlP38585 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TtlP38585 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TtlP38585 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TtlP38585 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
TtlP38585 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TtlP38585 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TtlP38585 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TtlP38585 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TtlP38585 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TtlP38585 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TtlP38585 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TtlP38585 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TtlP38585 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TtlP38585 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TtlP38585 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TtlP38585 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
TtlP38585 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
TtlP38585 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TtlP38585 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
TtlP38585 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
TtlP38585 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TtlP38585 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
TtlP38585 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
TtlP38585 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TtlP38585 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TtlP38585 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TtlP38585 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
TtlP38585 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TtlP38585 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TtlP38585 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
TtlP38585 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TtlP38585 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TtlP38585 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TtlP38585 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TtlP38585 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TtlP38585 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TtlP38585 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TtlP38585 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TtlP38585 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TtlP38585 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TtlP38585 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TtlP38585 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TtlP38585 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TtlP38585 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
TtlP38585 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TtlP38585 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TtlP38585 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TtlP38585 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TtlP38585 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TtlP38585 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TtlP38585 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TtlP38585 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
TtlP38585 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
TtlP38585 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
TtlP38585 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TtlP38585 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TtlP38585 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TtlP38585 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TtlP38585 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TtlP38585 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TtlP38585 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TtlP38585 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TtlP38585 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
TtlP38585 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TtlP38585 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TtlP38585 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 234.1 ms