Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RxraP28700 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RxraP28700 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RxraP28700 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RxraP28700 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RxraP28700 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RxraP28700 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RxraP28700 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RxraP28700 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
RxraP28700 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RxraP28700 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
RxraP28700 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RxraP28700 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RxraP28700 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
RxraP28700 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RxraP28700 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RxraP28700 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RxraP28700 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RxraP28700 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
RxraP28700 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
RxraP28700 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RxraP28700 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RxraP28700 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RxraP28700 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RxraP28700 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RxraP28700 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RxraP28700 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RxraP28700 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RxraP28700 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
RxraP28700 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RxraP28700 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RxraP28700 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RxraP28700 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RxraP28700 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RxraP28700 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RxraP28700 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
RxraP28700 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RxraP28700 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RxraP28700 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RxraP28700 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RxraP28700 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
RxraP28700 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
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RxraP28700 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RxraP28700 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RxraP28700 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RxraP28700 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RxraP28700 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RxraP28700 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RxraP28700 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RxraP28700 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RxraP28700 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RxraP28700 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RxraP28700 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RxraP28700 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RxraP28700 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RxraP28700 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RxraP28700 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RxraP28700 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
RxraP28700 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RxraP28700 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RxraP28700 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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RxraP28700 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
RxraP28700 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
RxraP28700 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RxraP28700 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RxraP28700 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RxraP28700 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RxraP28700 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
RxraP28700 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
RxraP28700 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RxraP28700 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
RxraP28700 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RxraP28700 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RxraP28700 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RxraP28700 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RxraP28700 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RxraP28700 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RxraP28700 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RxraP28700 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RxraP28700 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RxraP28700 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RxraP28700 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RxraP28700 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
RxraP28700 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RxraP28700 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RxraP28700 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RxraP28700 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RxraP28700 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RxraP28700 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RxraP28700 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RxraP28700 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RxraP28700 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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