Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Gm15036-201ENSMUST00000118880 400 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd12P23812 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.2 ms