Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PparaP23204 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PparaP23204 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PparaP23204 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PparaP23204 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PparaP23204 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PparaP23204 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PparaP23204 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PparaP23204 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PparaP23204 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PparaP23204 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PparaP23204 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PparaP23204 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PparaP23204 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PparaP23204 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PparaP23204 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PparaP23204 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PparaP23204 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PparaP23204 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PparaP23204 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PparaP23204 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PparaP23204 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PparaP23204 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PparaP23204 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PparaP23204 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PparaP23204 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PparaP23204 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PparaP23204 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PparaP23204 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PparaP23204 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PparaP23204 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PparaP23204 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PparaP23204 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PparaP23204 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PparaP23204 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PparaP23204 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PparaP23204 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PparaP23204 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PparaP23204 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PparaP23204 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PparaP23204 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PparaP23204 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PparaP23204 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PparaP23204 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PparaP23204 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PparaP23204 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PparaP23204 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PparaP23204 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PparaP23204 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PparaP23204 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PparaP23204 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PparaP23204 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PparaP23204 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PparaP23204 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PparaP23204 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PparaP23204 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PparaP23204 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PparaP23204 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PparaP23204 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PparaP23204 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PparaP23204 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PparaP23204 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PparaP23204 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PparaP23204 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PparaP23204 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PparaP23204 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PparaP23204 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PparaP23204 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PparaP23204 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PparaP23204 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PparaP23204 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PparaP23204 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PparaP23204 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PparaP23204 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PparaP23204 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PparaP23204 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PparaP23204 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PparaP23204 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PparaP23204 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PparaP23204 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PparaP23204 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PparaP23204 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PparaP23204 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PparaP23204 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PparaP23204 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PparaP23204 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PparaP23204 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PparaP23204 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PparaP23204 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PparaP23204 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PparaP23204 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PparaP23204 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
PparaP23204 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PparaP23204 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PparaP23204 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PparaP23204 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PparaP23204 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PparaP23204 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PparaP23204 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PparaP23204 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms