Protein–RNA interactions for Protein: P16305

Gabra6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra6P16305 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Dysf-211ENSMUST00000168387 6501 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.6 ms