Protein–RNA interactions for Protein: P01740

T-cell receptor gamma chain V region V108A, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01740 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01740 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01740 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01740 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01740 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01740 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01740 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01740 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01740 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01740 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01740 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01740 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01740 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01740 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01740 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01740 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01740 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01740 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01740 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01740 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01740 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01740 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01740 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01740 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01740 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01740 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01740 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01740 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01740 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01740 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01740 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01740 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01740 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01740 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01740 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01740 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01740 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01740 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01740 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01740 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01740 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01740 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01740 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01740 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01740 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01740 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01740 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01740 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01740 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01740 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01740 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01740 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01740 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01740 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01740 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01740 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01740 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01740 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01740 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01740 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01740 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01740 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01740 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01740 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01740 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01740 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01740 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01740 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01740 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01740 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01740 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01740 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01740 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01740 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01740 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01740 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01740 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
P01740 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
P01740 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01740 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01740 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01740 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01740 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01740 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01740 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01740 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01740 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
P01740 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01740 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01740 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01740 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01740 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01740 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01740 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01740 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01740 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01740 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01740 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01740 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01740 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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