Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Ccl20O89093 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
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Ccl20O89093 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Ccl20O89093 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Ccl20O89093 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Ccl20O89093 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Ccl20O89093 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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