Protein–RNA interactions for Protein: O88940

Msc, Musculin, mousemouse

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MscO88940 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
MscO88940 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
MscO88940 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
MscO88940 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
MscO88940 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
MscO88940 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
MscO88940 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
MscO88940 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
MscO88940 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
MscO88940 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
MscO88940 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
MscO88940 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
MscO88940 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
MscO88940 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
MscO88940 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
MscO88940 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
MscO88940 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
MscO88940 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
MscO88940 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
MscO88940 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
MscO88940 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
MscO88940 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
MscO88940 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
MscO88940 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
MscO88940 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
MscO88940 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
MscO88940 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
MscO88940 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
MscO88940 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
MscO88940 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
MscO88940 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
MscO88940 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
MscO88940 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
MscO88940 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
MscO88940 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
MscO88940 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
MscO88940 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
MscO88940 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
MscO88940 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
MscO88940 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
MscO88940 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
MscO88940 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
MscO88940 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
MscO88940 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
MscO88940 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
MscO88940 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
MscO88940 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
MscO88940 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
MscO88940 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
MscO88940 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
MscO88940 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
MscO88940 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
MscO88940 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
MscO88940 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
MscO88940 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
MscO88940 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
MscO88940 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
MscO88940 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
MscO88940 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
MscO88940 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
MscO88940 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
MscO88940 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
MscO88940 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
MscO88940 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
MscO88940 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
MscO88940 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
MscO88940 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
MscO88940 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
MscO88940 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
MscO88940 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
MscO88940 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
MscO88940 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
MscO88940 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
MscO88940 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
MscO88940 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
MscO88940 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
MscO88940 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
MscO88940 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
MscO88940 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
MscO88940 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
MscO88940 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
MscO88940 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
MscO88940 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
MscO88940 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
MscO88940 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
MscO88940 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
MscO88940 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
MscO88940 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
MscO88940 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
MscO88940 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
MscO88940 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
MscO88940 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
MscO88940 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
MscO88940 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
MscO88940 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
MscO88940 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
MscO88940 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
MscO88940 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
MscO88940 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
MscO88940 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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