Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
BlmO88700 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
BlmO88700 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
BlmO88700 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
BlmO88700 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
BlmO88700 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BlmO88700 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BlmO88700 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BlmO88700 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BlmO88700 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BlmO88700 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BlmO88700 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BlmO88700 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BlmO88700 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BlmO88700 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BlmO88700 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BlmO88700 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BlmO88700 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BlmO88700 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BlmO88700 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BlmO88700 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BlmO88700 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BlmO88700 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BlmO88700 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BlmO88700 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BlmO88700 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BlmO88700 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BlmO88700 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BlmO88700 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BlmO88700 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC18■□□□□ 0.47
BlmO88700 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC18■□□□□ 0.47
BlmO88700 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC18■□□□□ 0.47
BlmO88700 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC18■□□□□ 0.47
BlmO88700 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BlmO88700 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC18■□□□□ 0.47
BlmO88700 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC18■□□□□ 0.47
BlmO88700 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BlmO88700 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC18■□□□□ 0.47
BlmO88700 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
BlmO88700 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BlmO88700 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BlmO88700 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BlmO88700 Gm45500-201ENSMUST00000211676 803 ntBASIC18■□□□□ 0.47
BlmO88700 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BlmO88700 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC18■□□□□ 0.47
BlmO88700 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BlmO88700 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BlmO88700 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BlmO88700 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BlmO88700 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BlmO88700 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BlmO88700 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BlmO88700 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BlmO88700 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BlmO88700 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BlmO88700 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BlmO88700 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BlmO88700 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BlmO88700 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BlmO88700 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
BlmO88700 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC18■□□□□ 0.47
BlmO88700 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BlmO88700 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BlmO88700 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BlmO88700 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BlmO88700 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BlmO88700 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BlmO88700 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BlmO88700 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BlmO88700 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
BlmO88700 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BlmO88700 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BlmO88700 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BlmO88700 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BlmO88700 Txnrd2-205ENSMUST00000126778 491 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BlmO88700 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BlmO88700 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BlmO88700 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BlmO88700 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BlmO88700 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BlmO88700 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BlmO88700 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BlmO88700 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BlmO88700 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BlmO88700 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BlmO88700 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BlmO88700 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BlmO88700 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BlmO88700 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BlmO88700 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BlmO88700 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BlmO88700 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BlmO88700 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BlmO88700 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BlmO88700 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BlmO88700 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BlmO88700 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BlmO88700 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BlmO88700 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BlmO88700 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms