Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sp100O35892 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sp100O35892 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sp100O35892 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sp100O35892 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sp100O35892 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Sp100O35892 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Myh11-201ENSMUST00000090287 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sp100O35892 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sp100O35892 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Sp100O35892 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Sp100O35892 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Sp100O35892 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Sp100O35892 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Sp100O35892 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Sp100O35892 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sp100O35892 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sp100O35892 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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