Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
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Opn1mwO35599 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Opn1mwO35599 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Opn1mwO35599 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Opn1mwO35599 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Opn1mwO35599 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Opn1mwO35599 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Opn1mwO35599 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Opn1mwO35599 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Opn1mwO35599 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Opn1mwO35599 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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