Protein–RNA interactions for Protein: O35451

Atf6b, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6bO35451 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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