Protein–RNA interactions for Protein: M0QW51

Gm17078, Predicted gene 17078, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17078M0QW51 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm17078M0QW51 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm17078M0QW51 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm17078M0QW51 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm17078M0QW51 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm17078M0QW51 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm17078M0QW51 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm17078M0QW51 Nucks1-201ENSMUST00000062264 5998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm17078M0QW51 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm17078M0QW51 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm17078M0QW51 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm17078M0QW51 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm17078M0QW51 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm17078M0QW51 Nos1-206ENSMUST00000142742 10123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm17078M0QW51 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm17078M0QW51 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm17078M0QW51 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm17078M0QW51 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm17078M0QW51 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm17078M0QW51 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm17078M0QW51 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm17078M0QW51 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm17078M0QW51 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm17078M0QW51 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17078M0QW51 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17078M0QW51 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17078M0QW51 Atg2a-201ENSMUST00000045351 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17078M0QW51 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17078M0QW51 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17078M0QW51 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17078M0QW51 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17078M0QW51 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17078M0QW51 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17078M0QW51 Ddx3x-201ENSMUST00000000804 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17078M0QW51 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17078M0QW51 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17078M0QW51 Zfp964-203ENSMUST00000204285 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17078M0QW51 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17078M0QW51 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17078M0QW51 Trappc9-202ENSMUST00000089770 4047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17078M0QW51 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17078M0QW51 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17078M0QW51 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17078M0QW51 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17078M0QW51 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17078M0QW51 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17078M0QW51 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17078M0QW51 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17078M0QW51 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17078M0QW51 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17078M0QW51 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17078M0QW51 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17078M0QW51 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17078M0QW51 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17078M0QW51 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17078M0QW51 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17078M0QW51 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17078M0QW51 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17078M0QW51 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17078M0QW51 Gm42602-201ENSMUST00000200288 3224 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17078M0QW51 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17078M0QW51 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17078M0QW51 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17078M0QW51 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17078M0QW51 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17078M0QW51 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17078M0QW51 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17078M0QW51 P2ry1-202ENSMUST00000193201 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17078M0QW51 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17078M0QW51 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17078M0QW51 Nfkbiz-201ENSMUST00000036273 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17078M0QW51 Ippk-202ENSMUST00000220447 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17078M0QW51 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17078M0QW51 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17078M0QW51 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17078M0QW51 Sorbs3-203ENSMUST00000227653 3061 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17078M0QW51 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17078M0QW51 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17078M0QW51 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17078M0QW51 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17078M0QW51 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17078M0QW51 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17078M0QW51 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17078M0QW51 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17078M0QW51 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17078M0QW51 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17078M0QW51 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17078M0QW51 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17078M0QW51 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17078M0QW51 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17078M0QW51 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17078M0QW51 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17078M0QW51 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17078M0QW51 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17078M0QW51 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17078M0QW51 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17078M0QW51 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17078M0QW51 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17078M0QW51 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17078M0QW51 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms