Protein–RNA interactions for Protein: J3QPN2

Gm21870, Predicted gene, 21870, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21870J3QPN2 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21870J3QPN2 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21870J3QPN2 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21870J3QPN2 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21870J3QPN2 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21870J3QPN2 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21870J3QPN2 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21870J3QPN2 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Gm21870J3QPN2 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21870J3QPN2 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21870J3QPN2 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21870J3QPN2 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21870J3QPN2 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21870J3QPN2 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21870J3QPN2 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Gm21870J3QPN2 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21870J3QPN2 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Gm21870J3QPN2 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21870J3QPN2 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21870J3QPN2 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21870J3QPN2 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
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Gm21870J3QPN2 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21870J3QPN2 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21870J3QPN2 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21870J3QPN2 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21870J3QPN2 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21870J3QPN2 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21870J3QPN2 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21870J3QPN2 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21870J3QPN2 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21870J3QPN2 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21870J3QPN2 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21870J3QPN2 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21870J3QPN2 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21870J3QPN2 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21870J3QPN2 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21870J3QPN2 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Gm21870J3QPN2 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21870J3QPN2 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21870J3QPN2 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21870J3QPN2 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21870J3QPN2 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21870J3QPN2 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21870J3QPN2 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21870J3QPN2 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21870J3QPN2 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21870J3QPN2 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21870J3QPN2 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21870J3QPN2 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21870J3QPN2 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Gm21870J3QPN2 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Gm21870J3QPN2 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Gm21870J3QPN2 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Gm21870J3QPN2 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21870J3QPN2 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21870J3QPN2 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21870J3QPN2 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21870J3QPN2 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21870J3QPN2 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21870J3QPN2 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21870J3QPN2 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21870J3QPN2 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21870J3QPN2 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21870J3QPN2 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21870J3QPN2 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21870J3QPN2 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21870J3QPN2 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21870J3QPN2 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21870J3QPN2 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21870J3QPN2 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21870J3QPN2 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21870J3QPN2 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21870J3QPN2 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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