Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD5

Gm9602, Predicted gene 9602, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9602J3QPD5 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm9602J3QPD5 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm9602J3QPD5 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm9602J3QPD5 Apc-203ENSMUST00000115781 12346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm9602J3QPD5 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm9602J3QPD5 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm9602J3QPD5 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm9602J3QPD5 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm9602J3QPD5 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm9602J3QPD5 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm9602J3QPD5 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm9602J3QPD5 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm9602J3QPD5 AC154352.1-201ENSMUST00000221477 2365 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm9602J3QPD5 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm9602J3QPD5 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm9602J3QPD5 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm9602J3QPD5 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm9602J3QPD5 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm9602J3QPD5 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm9602J3QPD5 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm9602J3QPD5 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm9602J3QPD5 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm9602J3QPD5 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm9602J3QPD5 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm9602J3QPD5 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm9602J3QPD5 Lingo1-206ENSMUST00000210032 3627 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm9602J3QPD5 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm9602J3QPD5 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm9602J3QPD5 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm9602J3QPD5 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm9602J3QPD5 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm9602J3QPD5 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm9602J3QPD5 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm9602J3QPD5 Pla2g4a-201ENSMUST00000070200 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm9602J3QPD5 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm9602J3QPD5 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm9602J3QPD5 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm9602J3QPD5 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm9602J3QPD5 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm9602J3QPD5 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm9602J3QPD5 Acacb-202ENSMUST00000102582 8788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm9602J3QPD5 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm9602J3QPD5 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm9602J3QPD5 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm9602J3QPD5 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm9602J3QPD5 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm9602J3QPD5 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm9602J3QPD5 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm9602J3QPD5 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm9602J3QPD5 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm9602J3QPD5 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm9602J3QPD5 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm9602J3QPD5 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm9602J3QPD5 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm9602J3QPD5 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm9602J3QPD5 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm9602J3QPD5 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm9602J3QPD5 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm9602J3QPD5 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm9602J3QPD5 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm9602J3QPD5 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm9602J3QPD5 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm9602J3QPD5 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm9602J3QPD5 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm9602J3QPD5 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm9602J3QPD5 Aebp1-202ENSMUST00000109829 2541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm9602J3QPD5 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm9602J3QPD5 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm9602J3QPD5 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm9602J3QPD5 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm9602J3QPD5 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm9602J3QPD5 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm9602J3QPD5 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm9602J3QPD5 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm9602J3QPD5 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm9602J3QPD5 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm9602J3QPD5 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm9602J3QPD5 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm9602J3QPD5 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm9602J3QPD5 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm9602J3QPD5 Gm16348-202ENSMUST00000146654 2385 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm9602J3QPD5 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm9602J3QPD5 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm9602J3QPD5 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm9602J3QPD5 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm9602J3QPD5 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm9602J3QPD5 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm9602J3QPD5 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm9602J3QPD5 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm9602J3QPD5 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm9602J3QPD5 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm9602J3QPD5 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm9602J3QPD5 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm9602J3QPD5 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm9602J3QPD5 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm9602J3QPD5 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm9602J3QPD5 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm9602J3QPD5 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm9602J3QPD5 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm9602J3QPD5 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms